Jan. 14, 2022 As Alors que la variante Omicron a balayé les États-Unis, désormais responsable de plus de 98% des infections à COVID-19, la demande de tests dans les laboratoires a explosé since d’autant plus que les tests d’antigènes à domicile sont rares.
Les plaintes des candidats aux tests sont également en hausse, qui font écho à cette question anxieuse:
Qu’est-ce qui prend si longtemps pour obtenir des résultats?
Les délais d’exécution promis de 24 à 48 heures s’étendent sur plusieurs jours, car les gens se demandent s’ils doivent s’isoler ou poursuivre leur horaire régulier.
L’augmentation du volume est une raison majeure, bien sûr, mais pas la seule.
« Vous seriez surpris par les délais », déclare Dan Milner, MD, médecin en chef de l’American Society for Clinical Pathology, une organisation pour les professionnels de laboratoire.
Le voyage de l’écouvillon nasal – du point de collecte aux résultats du test arrivant par SMS ou par e-mail – est plus compliqué et plus compliqué que la plupart des gens ne le pensent, disent Milner et d’autres experts. Les nombreuses étapes en cours de route, ainsi que les problèmes de dotation en personnel et autres, y compris les épidémies de COVID-19 parmi le personnel des laboratoires, peuvent retarder le délai d’obtention des résultats.
Tout d’abord, la Question du Volume
Les statistiques nationales ainsi que les décomptes quotidiens des laboratoires individuels reflètent le boom des demandes de tests.
Le Janv. 11, la moyenne des tests COVID-19 aux États-Unis a atteint près de 2 millions par jour, une augmentation de 43 % sur une période de 14 jours.
Par Jan. 12, Quest Diagnostics, un laboratoire clinique comptant plus de 2 000 emplacements de patients aux États-Unis, avait enregistré 67,6 millions de tests COVID depuis le lancement du service en 2020. C’était une augmentation d’environ 3 millions depuis décembre. 21, quand leur total était de 64,7 millions.
Au laboratoire de microbiologie clinique de l’UCLA, plus de 2 000 tests COVID sont traités quotidiennement, contre 700 ou 800 il y a un mois, explique Omai B. Garner, PhD, directeur de la microbiologie clinique pour le système de santé de l’UCLA. Et il ne pense pas que la demande ait atteint un sommet.
À Tucson, en Arizona, chez Paradigm Site Services, qui passe des contrats avec les gouvernements locaux, les entreprises et d’autres pour fournir des tests, des tests 4,000 par jour sont effectués, contre un décompte quotidien de 1,000 début novembre, explique Steven Kelly, PDG.
Au-delà du volume, il existe d’autres obstacles qui contrecarrent le délai d’exécution prévu.
Collecte d’Écouvillons, Ramassage, Transport
« Les gens comprennent mal l’ensemble du processus », dit Garner. Une grande idée fausse est que l’écouvillon est analysé directement au point de collecte. Ce n’est généralement pas vrai – avec certains sites de test PCR rapides (et coûteux) parfois l’exception.
Une fois la collecte nasale terminée, l’échantillon est scellé dans un tube, puis envoyé à un laboratoire. Il peut être transporté par courrier à un laboratoire local à proximité, ou il peut être expédié beaucoup plus loin, surtout s’il est collecté dans une zone rurale.
« Quelqu’un pourrait être écouvillon et l’écouvillon doit sortir de l’état », dit Garner.
Et même un écouvillon transporté par courrier vers un laboratoire d’essais local pourrait prendre plus de temps que prévu, si le trafic est lourd ou si le temps devient mauvais.
En cours de route, le contrôle de la température est important, explique Kelly de Paradigm. » Les échantillons doivent être stockés à la bonne température. »Les coursiers stockent souvent les spécimens dans des glacières pour les transporter.
Arrivée au Labo
Une fois l’écouvillon arrivé au laboratoire, les échantillons doivent être enregistrés.
Ensuite, la rapidité avec laquelle il est testé dépend du volume de tests reçus en même temps — et de la capacité du laboratoire, en tenant compte du personnel et de l’équipement pour analyser les échantillons.
La dotation en personnel de laboratoire est un autre facteur. Comme la demande de tests a augmenté, les laboratoires ont du mal à ajouter suffisamment de personnel. Les exigences diffèrent d’un État à l’autre, dit Garner, mais ceux qui analysent les tests doivent être des scientifiques de laboratoire clinique ayant une formation et une expérience. Et comme d’autres entreprises, les laboratoires ont affaire à des employés qui contractent le COVID-19 et doivent quitter leur travail pour s’isoler.
Les employés de laboratoire potentiels doivent également bien faire face à une situation de haute pression, explique Kelly. Son entreprise a embauché 30 travailleurs de plus au cours des 3 dernières semaines, portant le total à 160. Certains travaillent 7 jours par semaine.
L’équipement d’essai – ou son absence – peut également ralentir le processus.
Alors que Garner dit qu’on lui demande souvent si de faux laboratoires de tests apparaissent, il dit qu’il n’en connaît aucun. Et il est assez facile de vérifier les informations d’identification d’un laboratoire.
Les laboratoires légitimes sont certifiés en vertu de la CLIA – les Modifications d’amélioration des laboratoires cliniques de 1988. En vertu de l’AICC, les normes fédérales s’appliquent à toutes les installations ou sites américains qui testent des spécimens humains pour évaluer la santé ou pour diagnostiquer, prévenir ou traiter des maladies. Le CDC a un Outil de Recherche de Laboratoire CLIA pour rechercher un laboratoire par son nom pour vérifier sa certification.
Les États peuvent également fournir des informations sur la certification et d’autres détails sur les essais. Par exemple, le Groupe de travail sur les tests COVID-19 en Californie publie son liste des laboratoires, détaillant les emplacements, le nombre de tests effectués chaque semaine et les délais d’exécution moyens.
Analyse au Laboratoire
Les laboratoires effectuent deux types de tests pour détecter la COVID-19. Les tests d’antigènes détectent certaines protéines dans le virus.
« Les tests d’antigènes en laboratoire ne sont pas très différents » des tests rapides à domicile, dit Milner. Une ligne de contrôle et une ligne de test sont utilisées pour détecter le virus.
Les tests PCR (réaction en chaîne par polymérase) détectent le matériel génétique du virus.
« L’ARN est extrait de l’échantillon et purifié via notre instrument d’extraction », explique Mariah Corbit, responsable de la conformité chez Paradigm Laboratories.
Des produits chimiques spéciaux et des enzymes sont ajoutés. Une machine PCR appelée thermocycleur effectue une série d’étapes de chauffage et de refroidissement pour analyser l’échantillon. La technologie PCR permet aux scientifiques d’amplifier de petites quantités d’ARN des spécimens en ADN, qui se réplique jusqu’à ce que tout virus présent soit détecté.
L’un des produits chimiques produit une lumière fluorescente si le virus se trouve dans l’échantillon. Ce signal est détecté par la machine PCR.
Le test PCR peut également donner une idée de la quantité de virus que la personne a, explique Chris Johnson, MD, directeur médical des services du site Paradigm.
Une fois que l’analyse commence, il est possible d’estimer la durée des résultats, explique Milner.
L’analyse la plus longue concerne le test PCR, qui varie d’un laboratoire à l’autre mais nécessite souvent environ 1,5 à 2 heures, dit-il. L’analyse du test d’antigène « prend au maximum 20 minutes », explique Milner.
Dans le cas des tests PCR rapides, qui promettent des résultats en 1 à 2 heures ou même moins mais peuvent coûter 300 $, le temps de traitement peut être modifié pour obtenir des résultats plus rapidement, explique Milner. Et en général, un résultat positif apparaît plus rapidement qu’un résultat négatif. « Si vous le lisez en temps réel, vous pouvez obtenir un résultat positif en 20 à 30 minutes et le signaler. »
Les installations proposant les tests rapides peuvent ne faire que des tests COVID et peuvent traiter les tests sur le même site, dit Milner, ce qui permet un délai d’exécution plus rapide. « S’ils sont certifiés CLIA, la qualité de ce test devrait être CORRECTE », dit-il.
La définition du délai d’exécution des tests non rapides par un laboratoire peut différer de celle de la personne en attente du résultat. Quest Diagnostics, par exemple, indique que son calendrier de redressement commence au fin de la journée sur lequel le spécimen est collecté et se termine à la fin de la journée sur lesquels les résultats sont rapportés.
Vérification Des Résultats
Un résultat positif est rapporté comme tel, tout comme un résultat négatif. « Il n’y a pas de test de confirmation », explique Garner. « C’est pourquoi les laboratoires doivent effectuer des tests fiables. »
Mais le test est répété si le résultat initial n’est pas concluant, dit Garner. Et si ce n’est pas concluant une deuxième fois? « Nous le libérons comme indéterminé », et un autre test peut être commandé.
Une fois finalisés, les résultats sont envoyés par SMS ou par e-mail.
Solutions À Long Terme
Aucun ralentissement de la demande n’étant prévu dans un avenir proche, des correctifs à long terme sont nécessaires.
» Du point de vue des laboratoires, nous sommes tous tellement frustrés de ne pas avoir l’infrastructure et la capacité nécessaires pour répondre aux besoins « , explique Garner. « En général, nous n’avons pas construit l’infrastructure de test nécessaire pour lutter contre la pandémie. »
Au début de la pandémie, dit-il, lorsque la demande a augmenté pour la première fois, « nous aurions dû considérer cela comme un besoin de construire l’infrastructure. »
Pendant ce temps, les directeurs de laboratoire savent à quel point les résultats rapides sont importants, mais ne sacrifieront pas la vitesse pour la précision. » Nous voulons nous assurer que c’est bien fait « , explique Kelly.
